香港中文大学一直重视与内地及大中华地区顶尖大学和研究机构建立紧密的伙伴关系，多元化的合作范围涵盖研究、师生交流、学术活动及联合办学，更积极在内地建立产学研及教育基地。国家的蓬勃发展和大湾区建设带来的机遇彰显与内地加强合作及开展策略项目的重要性。大学将继续融入发展大局，发挥香港的独特优势，为国家及全球发展做出贡献。
首届中国企业管理研讨会 (1982)
北京大学与中大签订交流协议 (1984)
中大在北京大学设立联络处 (1996)
中国大学校长联谊会 (1997)
深圳研究院正式落成启用，为中大于深圳及内地的发展开拓更广阔的空间，加强在教育、科研及产业化各方面合作 (2011)
香港中文大学（深圳）正式招生 (2014)
中大与中山大学及澳门大学共同发起成立粤港澳高校联盟，以汇集三地精英大学、培养人才及推动地区发展为目标，合作范畴包括科研、学生交流、协同创新及智库建设。
中大五所国家重点实验室伙伴实验室获国家科技部授牌，正名为「国家重点实验室」，进一步加强与内地不同院校及科研单位合作。 (2018)
中大成立香港中文大学深港创新研究院（福田），进一步推动粤港澳大湾区在智能医疗与公共卫生服务业领域的发展。 (2020)
中大与上海杨浦区政府签署合作协议，共同建设「香港中文大学上海中心」。 (2022)