崇基學院由香港聖公會領袖何明華會督、廣州嶺南大學前校長李應林和上海聖約翰大學前校董會主席歐偉國於1951年創辦,代表基督教在華發展高等教育傳統的延續,因而廣獲教會團體及社會各界慷慨支持,包括美國亞洲基督教高等教育聯合董事會、嶺南大學基金委員會及英國亞洲基督教大學聯合會等。
崇基學院於1955年依照香港政府法例註冊成立,並於1956年遷往香港政府撥贈馬料水土地作校址,崇基從此踏上穩步發展的道路。