香港中文大學圖書館特藏包括善本書、特色館藏、手稿和檔案文獻等,是教學和研究的重要資源。館藏善本書分中、西文兩部份,中文善本收錄自元朝(1271-1368)至清朝乾隆(1795)年間印刷之線裝書,西文善本則是收錄一九零零年以前出版之西文著作。圖書館收藏的商代甲骨數量更是全港同類收藏之最豐者。檔案館藏包括手稿和檔案資料兩種,珍貴檔案資料有霍克思(David Hawkes)文獻、傅利曼伉儷文獻(Maurice and Judith Freedman papers)和香港基督教工業委員會(HKCIC)檔案等;館藏手稿以香港作家和文人為主,以及中國作家高行健和北島。
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